Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSR3Q9UJK0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms