Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC39A9Q9NUM3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms