Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CAPZA3Q96KX2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms