Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKNOX2Q96KN3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms