Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRIPQ8WXE1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms