Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms