Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRRC8EQ6NSJ5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRRC8EQ6NSJ5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms