Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDZK1Q5T2W1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDZK1Q5T2W1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms