Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF2Q5BJF6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms