Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms