Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ALCAMQ13740 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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