Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNASE1L3Q13609 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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DNASE1L3Q13609 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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