Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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