Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms