Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNB3Q05901 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms