Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUCB1Q02818 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUCB1Q02818 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms