Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
APOC4P55056 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOC4P55056 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOC4P55056 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOC4P55056 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOC4P55056 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
APOC4P55056 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOC4P55056 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOC4P55056 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
APOC4P55056 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
APOC4P55056 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOC4P55056 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOC4P55056 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOC4P55056 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APOC4P55056 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOC4P55056 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOC4P55056 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms