Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RANGAP1P46060 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RANGAP1P46060 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms