Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTX2P32243 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms