Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms