Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MEFVO15553 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms