Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SOBPA7XYQ1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SOBPA7XYQ1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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