Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC69A6NI79 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms