Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C5orf49A4QMS7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms