Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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