Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX1-2Q9UD57 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms