Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.343e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL4A-204ENST00000585769 988 ntTSL 223.17■■□□□ 1.35e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.245e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.235e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C3orf18-211ENST00000491269 531 ntTSL 422.59■■□□□ 1.215e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.25e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.185e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMPO-209ENST00000549938 696 ntTSL 422.41■■□□□ 1.183e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SMIM19-208ENST00000529505 920 ntTSL 322.33■■□□□ 1.173e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.113e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.113e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PCTP-203ENST00000417982 2234 ntTSL 221.88■■□□□ 1.095e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PKD1-205ENST00000469241 659 ntTSL 221.87■■□□□ 1.093e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C3orf18-204ENST00000430746 1520 ntTSL 521.86■■□□□ 1.095e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C3orf18-210ENST00000486175 788 ntTSL 1 (best)21.86■■□□□ 1.095e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SLC22A18-208ENST00000467719 2635 ntTSL 1 (best)21.58■■□□□ 1.053e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.045e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL4A-202ENST00000355491 803 ntTSL 1 (best)21.54■■□□□ 1.045e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.033e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LCP1-204ENST00000442275 753 ntTSL 321.49■■□□□ 1.033e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PKD1-237ENST00000569983 722 ntTSL 521.47■■□□□ 1.033e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM150A-207ENST00000431593 2323 ntTSL 221.47■■□□□ 1.035e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.025e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.013e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 U2AF2-204ENST00000587275 554 ntTSL 421.33■■□□□ 1.013e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.973e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C3orf18-209ENST00000485902 638 ntTSL 1 (best)21.05■□□□□ 0.965e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PUF60-219ENST00000532127 604 ntTSL 220.95■□□□□ 0.948e-7■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.943e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P2-202ENST00000444583 1180 ntTSL 1 (best)20.86■□□□□ 0.935e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.895e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TAF10-202ENST00000527248 425 ntTSL 320.55■□□□□ 0.885e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 220.52■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BOLA3-205ENST00000484655 2982 ntTSL 1 (best)20.49■□□□□ 0.873e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MCF2L2-211ENST00000482017 570 ntTSL 420.26■□□□□ 0.835e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PDHB-203ENST00000461692 1535 ntTSL 1 (best)20.25■□□□□ 0.833e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TPD52-218ENST00000521354 785 ntTSL 219.98■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.785e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.773e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 GGNBP2-216ENST00000618837 2346 ntTSL 219.84■□□□□ 0.773e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.773e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LLGL2-222ENST00000583658 566 ntTSL 319.82■□□□□ 0.763e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SMIM19-207ENST00000518574 233 ntTSL 319.79■□□□□ 0.763e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.755e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SLC22A18-207ENST00000463571 1030 ntTSL 519.75■□□□□ 0.753e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.755e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.745e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.735e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.715e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMPO-205ENST00000546828 564 ntTSL 519.43■□□□□ 0.73e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMPO-208ENST00000548911 540 ntTSL 519.43■□□□□ 0.73e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.693e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.675e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATXN7-204ENST00000474112 3367 ntTSL 219.25■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 RIPOR1-209ENST00000564616 745 ntTSL 219.21■□□□□ 0.675e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.665e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 C3orf18-208ENST00000484982 565 ntTSL 419.13■□□□□ 0.655e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.11■□□□□ 0.655e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PPP2R3B-209ENST00000484364 732 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.653e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K3-206ENST00000479129 574 ntTSL 319.03■□□□□ 0.643e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF628-202ENST00000591164 472 ntTSL 219.03■□□□□ 0.643e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.643e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.643e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 VPS52-214ENST00000463486 925 ntTSL 518.91■□□□□ 0.623e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.615e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.615e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PDHB-208ENST00000480626 710 ntTSL 318.8■□□□□ 0.63e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-223ENST00000577256 613 ntTSL 418.77■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-224ENST00000578626 587 ntTSL 518.77■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PKD1-204ENST00000468674 490 ntTSL 518.76■□□□□ 0.593e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL4A-206ENST00000586612 448 ntTSL 318.74■□□□□ 0.595e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K3-213ENST00000583508 607 ntTSL 518.7■□□□□ 0.583e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K3-207ENST00000483928 511 ntTSL 518.7■□□□□ 0.583e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.583e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-230ENST00000583249 544 ntTSL 518.64■□□□□ 0.575e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-228ENST00000581438 619 ntTSL 318.64■□□□□ 0.575e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-225ENST00000579280 498 ntTSL 518.64■□□□□ 0.575e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.573e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-210ENST00000564788 582 ntTSL 318.63■□□□□ 0.573e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-25■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-25■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BOLA3-203ENST00000469676 1436 ntTSL 518.54■□□□□ 0.563e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SMIM19-206ENST00000498447 878 ntTSL 318.52■□□□□ 0.563e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MAP2K3-211ENST00000529517 514 ntTSL 418.46■□□□□ 0.553e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 SLC22A18-205ENST00000449603 682 ntTSL 318.39■□□□□ 0.533e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 NSUN5P2-204ENST00000485741 1647 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.535e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.535e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 PKD1-214ENST00000483024 465 ntTSL 518.33■□□□□ 0.523e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 VPS52-215ENST00000464425 1060 ntTSL 518.25■□□□□ 0.513e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MEX3C-201ENST00000406189 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.495e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATG13-226ENST00000580238 624 ntTSL 418.06■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 167.7
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