Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PECRQ9BY49 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PECRQ9BY49 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms