Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RNF183Q96D59 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms