Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms