Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TOLLIP-213ENST00000532551 576 ntTSL 212.7□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 GTF2IP20-203ENST00000634905 2966 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TTC28-AS1-203ENST00000419253 846 ntTSL 1 (best)12.23□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-216ENST00000587190 553 ntTSL 412.23□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NR4A1-210ENST00000548733 535 ntTSL 312.22□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TAF1-207ENST00000461764 1841 ntTSL 512.18□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-210ENST00000585323 381 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-220ENST00000475027 599 ntTSL 512.1□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-233ENST00000591989 233 ntTSL 312.06□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-201ENST00000299088 3354 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 OSBPL10-208ENST00000466604 758 ntTSL 311.87□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-216ENST00000555575 568 ntTSL 411.82□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 EML3-218ENST00000533165 524 ntTSL 311.82□□□□□ -0.529e-10■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 211.7□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 39.2
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TBRG4Q969Z0 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TBCD-224ENST00000576760 1059 ntTSL 511.51□□□□□ -0.579e-10■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TDG-201ENST00000266775 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TAF1-218ENST00000485087 1738 ntTSL 511.4□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 511.22□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 39.2
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TBRG4Q969Z0 TAF1-211ENST00000468167 1767 ntTSL 511.05□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 39.2
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TBRG4Q969Z0 STAG1-207ENST00000483235 5206 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-212ENST00000553958 588 ntTSL 410.94□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 39.2
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TBRG4Q969Z0 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.842e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 RERE-205ENST00000460659 454 ntTSL 29.8□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRKAA1-208ENST00000511248 668 ntTSL 29.76□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 39.2
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TBRG4Q969Z0 TAF1-205ENST00000437147 2295 ntTSL 1 (best)9.51□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PAAF1-209ENST00000540659 349 ntTSL 39.5□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 39.2
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TBRG4Q969Z0 SH3YL1-229ENST00000626873 1973 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TAF1-208ENST00000462588 1826 ntTSL 1 (best)9.43□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 RPN2-207ENST00000462163 712 ntTSL 39.41□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SC5D-203ENST00000524683 2391 ntTSL 29.41□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PTBP3-208ENST00000487997 389 ntTSL 39.4□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 AL132780.5-201ENST00000623843 1625 ntBASIC9.4□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TDG-202ENST00000392872 3251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-211ENST00000553931 585 ntTSL 29.33□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 OSBPL10-216ENST00000480671 492 ntTSL 39.31□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TTLL3-217ENST00000439814 497 ntTSL 49.29□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-218ENST00000556419 499 ntTSL 49.21□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-217ENST00000555998 571 ntTSL 49.01□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 C14orf93-221ENST00000557513 590 ntTSL 49.01□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 ARHGEF10L-205ENST00000466782 482 ntTSL 38.84□□□□□ -0.994e-12■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-221ENST00000588066 579 ntTSL 58.84□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 BBX-217ENST00000456419 871 ntTSL 58.79□□□□□ -12e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 PRKAA1-203ENST00000397006 425 ntTSL 38.78□□□□□ -12e-8■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 39.2
TBRG4Q969Z0 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 39.2
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