RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587190.5

NEDD4L-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-216ENST00000587190 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
NEDD4L-216ENST00000587190 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.81■■■□□ 2.68
NEDD4L-216ENST00000587190 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
NEDD4L-216ENST00000587190 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
NEDD4L-216ENST00000587190 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.87■■■□□ 2.05
NEDD4L-216ENST00000587190 FOXD1Q16676 465 aa26.71■■□□□ 1.87
NEDD4L-216ENST00000587190 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.4■■□□□ 1.66
NEDD4L-216ENST00000587190 MSH5O43196 834 aa25.12■■□□□ 1.61
NEDD4L-216ENST00000587190 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NEDD4L-216ENST00000587190 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.87■■□□□ 1.57
NEDD4L-216ENST00000587190 ADRA2BP18089 450 aa24.8■■□□□ 1.56
NEDD4L-216ENST00000587190 POTEDQ86YR6 584 aa24.62■■□□□ 1.53
NEDD4L-216ENST00000587190 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.54■■□□□ 1.52
NEDD4L-216ENST00000587190 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NEDD4L-216ENST00000587190 ABCC9O60706 1549 aa23.09■■□□□ 1.29
NEDD4L-216ENST00000587190 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.07■■□□□ 1.28
NEDD4L-216ENST00000587190 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD4L-216ENST00000587190 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD4L-216ENST00000587190 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
NEDD4L-216ENST00000587190 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD4L-216ENST00000587190 NACADO15069 1562 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD4L-216ENST00000587190 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD4L-216ENST00000587190 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD4L-216ENST00000587190 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD4L-216ENST00000587190 SCRIBQ14160 1630 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD4L-216ENST00000587190 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD4L-216ENST00000587190 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD4L-216ENST00000587190 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.86■■□□□ 1.09
NEDD4L-216ENST00000587190 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.86■■□□□ 1.09
NEDD4L-216ENST00000587190 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NEDD4L-216ENST00000587190 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD4L-216ENST00000587190 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
NEDD4L-216ENST00000587190 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NEDD4L-216ENST00000587190 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
NEDD4L-216ENST00000587190 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
NEDD4L-216ENST00000587190 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD4L-216ENST00000587190 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NEDD4L-216ENST00000587190 SMARCA4P51532 1647 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD4L-216ENST00000587190 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEDD4L-216ENST00000587190 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD4L-216ENST00000587190 WIZO95785 1651 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD4L-216ENST00000587190 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD4L-216ENST00000587190 RNF39Q9H2S5 420 aa21.38■■□□□ 1.01
NEDD4L-216ENST00000587190 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
NEDD4L-216ENST00000587190 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.23■□□□□ 0.99
NEDD4L-216ENST00000587190 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
NEDD4L-216ENST00000587190 SMARCA2P51531 1590 aa21.18■□□□□ 0.98
NEDD4L-216ENST00000587190 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.17■□□□□ 0.98
NEDD4L-216ENST00000587190 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
NEDD4L-216ENST00000587190 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.08■□□□□ 0.97
NEDD4L-216ENST00000587190 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
NEDD4L-216ENST00000587190 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
NEDD4L-216ENST00000587190 HMGXB3Q12766 1538 aa20.99■□□□□ 0.95
NEDD4L-216ENST00000587190 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.96■□□□□ 0.95
NEDD4L-216ENST00000587190 NCAPD3P42695 1498 aa20.88■□□□□ 0.93
NEDD4L-216ENST00000587190 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.87■□□□□ 0.93
NEDD4L-216ENST00000587190 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.939e-7■■□□□ 12.2
NEDD4L-216ENST00000587190 PRDM2Q13029 1718 aa20.64■□□□□ 0.9
NEDD4L-216ENST00000587190 KCNA4P22459 653 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD4L-216ENST00000587190 ABCC8Q09428 1581 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD4L-216ENST00000587190 CFTRP13569 1480 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD4L-216ENST00000587190 TRIM41Q8WV44 630 aa20.41■□□□□ 0.86
NEDD4L-216ENST00000587190 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NEDD4L-216ENST00000587190 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD4L-216ENST00000587190 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD4L-216ENST00000587190 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
NEDD4L-216ENST00000587190 SYNJ1O43426 1573 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD4L-216ENST00000587190 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD4L-216ENST00000587190 TOP2BQ02880 1626 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD4L-216ENST00000587190 NESP48681 1621 aa20.22■□□□□ 0.83
NEDD4L-216ENST00000587190 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.18■□□□□ 0.82
NEDD4L-216ENST00000587190 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD4L-216ENST00000587190 CUX1P39880 1505 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD4L-216ENST00000587190 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD4L-216ENST00000587190 CAPN15O75808 1086 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD4L-216ENST00000587190 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD4L-216ENST00000587190 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD4L-216ENST00000587190 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.08■□□□□ 0.8
NEDD4L-216ENST00000587190 SLC4A2P04920 1241 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD4L-216ENST00000587190 EEA1Q15075 1411 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD4L-216ENST00000587190 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
NEDD4L-216ENST00000587190 DSG3P32926 999 aa19.98■□□□□ 0.79
NEDD4L-216ENST00000587190 TOPBP1Q92547 1522 aa19.97■□□□□ 0.79
NEDD4L-216ENST00000587190 SOGA1O94964 1423 aa19.97■□□□□ 0.79
NEDD4L-216ENST00000587190 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.96■□□□□ 0.79
NEDD4L-216ENST00000587190 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
NEDD4L-216ENST00000587190 APLP2Q06481 763 aa19.9■□□□□ 0.78
NEDD4L-216ENST00000587190 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.89■□□□□ 0.77
NEDD4L-216ENST00000587190 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.89■□□□□ 0.77
NEDD4L-216ENST00000587190 ERCC6Q03468 1493 aa19.88■□□□□ 0.77
NEDD4L-216ENST00000587190 WDR97A6NE52 1622 aa19.87■□□□□ 0.77
NEDD4L-216ENST00000587190 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NEDD4L-216ENST00000587190 KIF21BO75037 1637 aa19.84■□□□□ 0.77
NEDD4L-216ENST00000587190 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.83■□□□□ 0.77
NEDD4L-216ENST00000587190 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
NEDD4L-216ENST00000587190 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
NEDD4L-216ENST00000587190 KIF27Q86VH2 1401 aa19.83■□□□□ 0.76
NEDD4L-216ENST00000587190 WDR62O43379 1518 aa19.81■□□□□ 0.76
NEDD4L-216ENST00000587190 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
NEDD4L-216ENST00000587190 CUX2O14529 1486 aa19.79■□□□□ 0.76
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