Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms