Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC80Q76M96 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC80Q76M96 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms