Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AGAP6Q5VW22 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGAP6Q5VW22 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms