Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms