Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RTN1Q16799 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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