Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CST6Q15828 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CST6Q15828 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CST6Q15828 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms