Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMCO1Q147U7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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