Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LSAMPQ13449 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LSAMPQ13449 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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