Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 13e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.133e-15■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 COPZ1-201ENST00000262061 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.481e-8■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MPDU1-211ENST00000572936 1102 ntTSL 521.93■■□□□ 1.14e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MPDU1-209ENST00000572719 917 ntTSL 59.68□□□□□ -0.864e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MPDU1-215ENST00000576272 809 ntTSL 29.36□□□□□ -0.914e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 USF2-215ENST00000602164 582 ntTSL 331.93■■■□□ 2.75e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 USF2-210ENST00000598058 510 ntTSL 223.9■■□□□ 1.425e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.819e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 RPL21-206ENST00000466550 756 ntTSL 213.84□□□□□ -0.198e-22■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-34■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 RPS3-213ENST00000529285 550 ntTSL 524.13■■□□□ 1.453e-37■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.063e-8■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 GNB2-212ENST00000470354 902 ntTSL 523.83■■□□□ 1.419e-12■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.293e-8■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.837e-10■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 TPM3-221ENST00000513769 539 ntTSL 311.16□□□□□ -0.622e-26■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 TPM3-203ENST00000312970 750 ntTSL 59.95□□□□□ -0.822e-26■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.823e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 STARD10-216ENST00000542989 839 ntTSL 324.27■■□□□ 1.484e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.562e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 RDH13-218ENST00000591868 143 ntTSL 510.61□□□□□ -0.718e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CYBA-207ENST00000566534 1006 ntTSL 516.57■□□□□ 0.244e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CLTA-208ENST00000493185 714 ntTSL 324.98■■□□□ 1.591e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 YIF1A-212ENST00000528575 532 ntTSL 322.33■■□□□ 1.173e-6■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 YIF1A-204ENST00000431556 619 ntTSL 218.69■□□□□ 0.583e-6■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.473e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 GABARAP-206ENST00000577035 762 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.173e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 GUK1-232ENST00000486668 738 ntTSL 315.57■□□□□ 0.083e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.571e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.143e-12■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.063e-12■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CSRP1-216ENST00000532460 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-12■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CSRP1-207ENST00000526256 582 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.423e-12■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 DCXR-209ENST00000579155 430 ntTSL 522.18■■□□□ 1.147e-11■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.169e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 ADIPOR2-201ENST00000357103 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.565e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.285e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 YBX3-217ENST00000546164 805 ntTSL 214.22□□□□□ -0.133e-49■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 YBX3-206ENST00000536823 840 ntTSL 28.45□□□□□ -1.063e-49■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CPNE1-228ENST00000498814 550 ntTSL 318.39■□□□□ 0.532e-15■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CPNE1-209ENST00000415920 731 ntTSL 516.03■□□□□ 0.162e-15■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CPNE1-222ENST00000473373 821 ntTSL 213.88□□□□□ -0.192e-15■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CPNE1-221ENST00000462352 625 ntTSL 213.86□□□□□ -0.192e-15■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.982e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 C19orf47-207ENST00000582734 1977 ntTSL 218.45■□□□□ 0.542e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 C19orf47-209ENST00000584868 583 ntTSL 217.77■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 C19orf47-203ENST00000577617 550 ntTSL 317.6■□□□□ 0.412e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 SLC25A39-211ENST00000588767 807 ntTSL 517.87■□□□□ 0.451e-6■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 COQ4-203ENST00000461102 3127 ntTSL 212.52□□□□□ -0.413e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-323■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.231e-323■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.211e-323■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-323■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.611e-323■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 ZWINT-205ENST00000460654 830 ntTSL 317.35■□□□□ 0.371e-36■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 ZWINT-208ENST00000489649 1621 ntTSL 515.98■□□□□ 0.151e-36■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 ZWINT-209ENST00000494312 1961 ntTSL 215.35■□□□□ 0.051e-36■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 ZWINT-203ENST00000373944 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.141e-36■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 ZWINT-201ENST00000318387 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-36■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 ZWINT-204ENST00000395405 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.481e-36■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.113e-6■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 PLIN2-205ENST00000464326 790 ntTSL 26.06□□□□□ -1.443e-6■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 PSMD11-205ENST00000493026 2387 ntTSL 213.85□□□□□ -0.193e-15■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS8-202ENST00000432321 936 ntTSL 218.95■□□□□ 0.624e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS8-203ENST00000453471 620 ntTSL 318.37■□□□□ 0.534e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS8-215ENST00000532399 3072 ntTSL 215.13■□□□□ 0.014e-7■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.561e-18■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.411e-18■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 TNNT1-216ENST00000593046 800 ntTSL 216.5■□□□□ 0.236e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.082e-10■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-10■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.094e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS7-215ENST00000546172 869 ntTSL 521.64■■□□□ 1.054e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS7-213ENST00000543289 3356 ntTSL 220.34■□□□□ 0.854e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.834e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS7-205ENST00000534853 745 ntTSL 518.56■□□□□ 0.564e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.564e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 NDUFS7-214ENST00000545446 3089 ntTSL 214.92□□□□□ -0.024e-9■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.75e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 210.91□□□□□ -0.667e-10■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CTSH-202ENST00000525807 1122 ntTSL 522.82■■□□□ 1.247e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.887e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CTSH-213ENST00000533777 2101 ntTSL 1 (best)19.21■□□□□ 0.677e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 CTSH-204ENST00000527715 2138 ntTSL 1 (best)12.74□□□□□ -0.377e-8■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 RPL22-207ENST00000484532 449 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.858e-12■■■□□ 17.2
PABPC4Q13310 UBA52-206ENST00000596272 508 ntTSL 27.28□□□□□ -1.247e-36■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SAMD5-202ENST00000566741 393 ntTSL 37.06□□□□□ -1.285e-8■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.655e-8■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 AL033504.1-202ENST00000432506 406 ntTSL 23.48□□□□□ -1.855e-8■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 RTN4-214ENST00000486085 955 ntTSL 38.68□□□□□ -1.022e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.71e-323■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-323■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 RPL36A-205ENST00000465744 710 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.082e-23■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.212e-23■■■□□ 17.1
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 229.9 ms