Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms