Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT10P13645 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT10P13645 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT10P13645 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT10P13645 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT10P13645 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT10P13645 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms