Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPRP12270 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPRP12270 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TPRP12270 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPRP12270 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRP12270 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRP12270 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRP12270 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRP12270 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms