Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB5P09067 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms