Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F6O75461 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F6O75461 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F6O75461 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms