Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA2Q9UM44 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms