Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms