Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD4L4Q8WXT5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD4L4Q8WXT5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms