Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C17orf50Q8WW18 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms